Отдел экологии вирусов
Руководитель – доктор медицинских наук Е.И.Бурцева
Лаборатория экологии вирусов
Руководитель – кандидат биологических наук И.Т.Федякина.
Лаборатория была создана в 1968 г. по инициативе академика РАН Д.К.Львова, который на протяжении более четырех десятилетий являлся ее бессменным руководителем. С 2010 г. по 2014 г. лабораторию возглавлял ученик и последователь идей академика Д.К.Львова – доктор биологических наук М.Ю.Щелканов. С 2014 г. руководителем лаборатории назначена кандидат биологических наук И.Т.Федякина. Круг научных интересов – изучение противовирусной активности и механизмов действия химиопрепаратов в отношении гриппозной инфекции in vitro и in vivo, вызванной штаммами вируса гриппа А, хранящимися в Государственной коллекции вирусов, и вирусов гриппа птиц и человека, изолированных в лаборатории.
Традиционно основное направление исследований лаборатории – изучение новых и вновь возникающих вирусных инфекций с особым вниманием к агентам с высокой степенью изменчивости генома. Комплексные исследования направлены на изучение эволюции возбудителей. Изучение экологии возбудителей, межпопуляционных взаимодействий между позвоночными хозяевами (включая человека), вирусами, членистоногими переносчиками в разнообразных условиях среды обитания, анализ возникших эпидемических ситуаций – позволяют прогнозировать будущие эпидемические ситуации на территории РФ и сопредельных стран. Использование при этом молекулярно-генетических методов дает возможность определить тенденции в изменении генетических свойств вирусных популяций, создать условия для разработки эффективных диагностических и профилактических препаратов. На основе экологического подхода разработана принципиальная схема циркуляции арбовирусов в разных климатических поясах. Исходя из теоретических предпосылок, проведено обследование территории Северной Евразии на арбовирусы. В результате, изолировано 69 вирусов, 24 из которых зарегистрированы в Международном каталоге в качестве новых для науки. Описаны не известные ранее инфекции – Карельская лихорадка, Иссык-Кульская лихорадка, лихорадки Карши, Тамды, долины Сыр-Дарьи. Разработан прогноз возникновения эпидемических вспышек в различных ландшафтных поясах на территории России. Методами молекулярной экологии проведена генетическая характеристика вирусов Крымской геморрагической лихорадки и лихорадки Западного Нила (ЛЗН), вызвавших обширные эпидемические вспышки в 1999-2002 гг. на юге России. Показана идентичность геномов штаммов вируса ЛЗН, изолированных в этот период в России и США. За последние три года, совместно со специалистами лаборатории биотехнологии, впервые в мире генетически охарактеризованы более 300 штаммов зоонозных РНК-содержащих вирусов, принадлежащих семи семействам. Из них более 50 описаны как новые виды вирусов.
Экологический подход использован для изучения механизмов возникновения новых пандемических вирусов гриппа А. Установлена активная циркуляция 14 различных вирусов гриппа А в природных биоценозах Северной Евразии, в том числе – генетических вариантов, которые расцениваются в качестве возможных предшественников новых пандемических вирусов.
Ведется мониторинг генотипной композиции вируса гепатита С на территории РФ. Показано постоянное изменение процентного соотношения отдельных генотипов вируса, появление рекомбинантных форм этого вируса на территориях, ранее свободных от него. Обнаружен новый субтип вируса гепатита С.
В лаборатории разрабатываются модели для оценки эффективности новых лекарственных препаратов и химических соединений в отношении вируса гриппа в культуре клеток и на животных.
Для лаборатории характерно широкое внутри- и межинститутское комплексирование. Работа сотрудников лаборатории отмечена Государственной премией РФ, премией Совета Министров СССР и премиями имени Д.И.Ивановского РАМН.
Лаборатория этиологии и эпидемиологии гриппа
Руководитель – доктор медицинских наук Е.И.Бурцева.
У истоков исследований, которые проводятся в настоящее время в лаборатории, стояли: Заслуженный деятель науки РСФСР, профессор М.И.Соколов, профессор А.С.Горбунова, академик АМН СССР В.М.Жданов, Заслуженный деятель науки РСФСР, профессор Л.Я.Закстельская, Заслуженный деятель науки РФ, профессор А.Н.Слепушкин.
В соответствии с приказом Роспотребнадзора №373 от 31 марта 2005 г. «О совершенствовании системы эпидемиологического надзора и контроля за гриппом и острыми респираторными вирусными инфекциями», на лабораторию были возложены функции Центра экологии и эпидемиологии гриппа (ЦЭЭГ). В целях дальнейшей реализации на территории РФ Международных медико-санитарных правил (ММСП 2005), приказом Роспотребнадзора №88 от 17 марта 2008 г. «О мерах по совершенствованию мониторинга за возбудителями инфекционных и паразитарных заболеваний», на лабораторию возложены функции одного их четырех Референс-центров по мониторингу за гриппом в РФ.
В лаборатории ведутся исследования по изучению антигенных, биологических и молекулярно-генетических свойств циркулирующих штаммов вирусов гриппа с применением следующих методов: изоляция штаммов на клетках культуры ткани MDCK и куриных эмбрионах, РГА, РТГА, ИФА, микронейтрализация, ПЦР и ПЦР-РВ. Используются животные модели для получения иммунных сывороток. Осуществляется пополнение Государственной коллекции вирусов образцами оригинальных эпидемических и пандемических штаммов.
Еженедельно в лаборатории проводится анализ поступающих данных по заболеваемости гриппом и ОРВИ в разных возрастных группах и данных лабораторной диагностики на отдельных территориях РФ, которые обобщаются, оформляются и представляются в Минздрав России, Роспотребнадзор, НИИ гриппа, сотрудничающим учреждениям здравоохранения.
На лабораторию возложены функции Национального центра по гриппу (НЦГ), сотрудничающего с ВОЗ. В рамках международного сотрудничества осуществляется обмен данными по лабораторной диагностике, референс-штаммами, эпидемическими штаммами и диагностическими препаратами между лабораторией и Сотрудничающими центрами ВОЗ по гриппу (Лондон, Великобритания; Атланта, США). Ежегодно, согласно рекомендациям ВОЗ, лаборатория участвует в квалификационных проверках качества выполняемых исследований для подтверждения статуса НЦГ.
Выполняются фундаментальные исследования практической направленности по использованию нанотехнологий для диагностики и профилактики гриппа и ОРВИ.
Бурцева Елена Ивановна